Atomkoordinaten aus Strukturformeln organischer Verbindungen

Zusammenfassung

Für computerunterstützte Manipulationen von Molekülmodellen braucht man die Koordinaten der entsprechenden Atome im Rechner. Es wird ein Programmpaket zur Erzeugung von Koordinatensätzen von acyclischen Verbindungen mit folgenden Leistungsmerkmalen vorgestellt:

• Die Lagen der Atome eines Moleküls in seiner zick-zack-Konformation werden unter Zugriff auf Listen mit Standardwerten für Bindungslängen und -winkel in weniger als 1 Minute errechnet. Maximal 500 Atome (C,H,O,N,S/zweibindig,Cl,Br,I) werden gegenwärtig verarbeitet.

• Die Eingabe der (zweidimensionalen) Strukturformel erfolgt über einen zeilen- und spaltenorientierten Editor in einer dem Chemiker vom Formelzeichnen im Prinzip vertrauten Weise. Langwieriges Einarbeiten entfällt.

• Mit einem im Sekundenbereich arbeitenden Graphikprogramm kann anschließend ein Bild des Moleküls mit räumlichem Eindruck erhalten werden. Bei Bedarf kann das Molekül um einen gewünschten Betrag um die x-, y- und z-Achse gedreht werden.

• Die Programme laufen auf einem Arbeitsplatzrechner vom Typ XT/AT, so daß der Zugang zu einem Mini- oder Großrechner in dieser Phase entbehrlich ist.