Mutationsprofile von Tumoren jenseits von Organ- und Gewebespezifität

Zusammenfassung

Diagnostik und Therapie von Krebserkrankungen basieren auf dem Paradigma, dass maligne Tumoren organ- und gewebespezifisch sind. Aus Next-Generation-Sequenzierungsprojekten seit Kurzem verfügbare umfassende Daten über die Mutationsprofile von Tumoren ermöglichen es zu untersuchen, ob sich die anatomische Tumorklassifikation auf Ebene der genetischen Veränderungen von Tumoren widerspiegelt. In der vorliegenden Arbeit präsentieren wir Ergebnisse einer Analyse von 4796 Tumoren aus 14 Tumorentitäten der TCGA-Datenbank (The Cancer Genome Atlas), die zeigen, dass durchschnittlich 43 % der Tumoren einer Entität genetisch ähnlicher sind zu Tumoren eines anderen anatomischen Ursprungs und entsprechend in nur 57 % der Fälle der genetische mit dem anatomischen Tumortyp übereinstimmt. Wir diskutieren die Bedeutung der komplexen Mutationsprofile und Ähnlichkeitsmuster für Diagnostik und klinisches Studiendesign und erklären, warum die umfassenden genomischen Daten durch funktionell-proteomische Analysen ergänzt werden sollten.

Abstract

The diagnostics and therapy of malignant tumors are based on the paradigm that cancer is an organ and tissue-specific disease. Comprehensive tumor mutation profiling data that has recently become available from next generation sequencing projects has made it possible to analyze whether the established anatomical tumor classification is reflected on the genetic level. Here, we review the results of a study on 4796 tumors of 14 major cancer types from the cancer genome atlas (TCGA) database, that on average 43 % of tumors of a particular type are genetically more similar to tumors of a different anatomical origin and that the genetic tumor type corresponds to the anatomical type in only 57 % of the cases. Furthermore, we discuss the implications of the complex mutation profiles and similarity patterns across cancers for diagnostics and clinical study design and explain why the comprehensive genomic data should be complemented by functional proteomic analyses.