Zusammenfassung
Alle Moleküle einer Zelle stehen eng miteinander in Bezug. Nur diese Kontext-bezogene Information hat wirklich Bedeutung. Sie vermittelt das Verhalten der Zelle, das für das Überleben wichtig und richtig ist. Druckfehler werden in der Population ständig weg selektiert. Datenbanksuchen und Sequenzvergleiche erschließen diese biologische Bedeutung (in der Praxis meist die Funktion des verglichenen Moleküls). Diese ist stark an Sequenzelemente und eine definierte Struktur gebunden, Zufallssequenzen ergeben keinen biologischen Sinn. Schon die Domänen in einem Enzym beziehen sich aufeinander, z. B. bei der Glutathionreduktase: Zu der katalytischen Domäne gibt es die passenden zwei Kofaktor-Domänen (für FAD, NAD), die optimale regulatorische Domäne und auch die Dimerisierungsdomäne, sonst würde das Enzym nicht funktionieren. Ebenso überprüft man die Stimmigkeit von Sequenzanalysen. Alles muss zueinander passen, ergeben sich Widersprüche, war eine der Teilanalyseergebnisse noch nicht richtig eingeordnet. Auch auf der Ebene der Proteinnetzwerke bezieht sich alles aufeinander, es können durch Netzwerkanalysen entziffert werden: Zentrale Proteine (‚Hubs‘), Signalkaskaden und Störsignale sowie modifizierenden Input (‚Cross-talk‘). Ein faszinierendes und anschauliches Beispiel ist die ‚subway map of cancer pathways‘.
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Dandekar, T., Kunz, M. (2021). Leben entwickelt immer neue Information im Dialog mit der Umwelt. In: Bioinformatik. Springer Spektrum, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-662-62399-2_12
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