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Segmentierung von Makrophagen in Fluoreszenzbildern mittels Fast Marching Level Set Verfahren

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Bildverarbeitung für die Medizin 2011

Part of the book series: Informatik aktuell ((INFORMAT))

  • 1575 Accesses

Kurzfassung

Die Erkennung von mikrobiellen Gefahrensignalen durch Makrophagen führt zu ausgeprägten Veränderungen des Zytoskeletts. Die daraus resultierende morphologische Veränderung (Spreading) führt zur Variation der Kontaktfläche zwischen Zellen und Oberflächenmaterial. Bisher wird die Vermessung durch manuelle Annotation einer jeden einzelnen Zelle durchgeführt. Dieser sehr zeitaufwendige Schritt soll durch den Einsatz von semi-automatischen Werkzeugen unterstützt und beschleunigt werden. Hierfür wird ein multimodales Segmentierungsverfahren erstellt, das mittels erweiterter Wasserscheidentransformation eine Segmentierung der Zellkerne in DAPI Färbung erstellt. Diese Information über die Zellkerne wird als Initialisierung für ein Fast Marching Level Set Verfahren verwendet um mittels Anti-CD11b-APC gefärbte Makrophagen zu segmentieren. Dabei zeigt sich dass durch den multimodalen Ansatz gute Segmentierungsergebnisse auch bei konfluenten Zellbildern möglich sind.

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Author information

Authors and Affiliations

  1. Fraunhofer Institut für Integrierte Schaltungen, Erlangen, Erlangen, Deutschland

    Christian Held & Thomas Wittenberg

  2. Institut für Immunologie und Hygiene, Universität Erlangen, Erlangen, Deutschland

    Jens Wenzel, Palmisano Ralf & Roland Lang

Authors
  1. Christian Held
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  2. Jens Wenzel
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  3. Palmisano Ralf
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  4. Roland Lang
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  5. Thomas Wittenberg
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Corresponding author

Correspondence to Christian Held .

Editor information

Editors and Affiliations

  1. , Institut für Medizinische Informatik, Universität zu Lübeck, Ratzeburger Allee 160, Lübeck, 23562, Germany

    Heinz Handels

  2. , Institut für Medizinische Informatik, Universität Lübeck, Ratzeburger Allee 160, Lübeck, 23538, Germany

    Jan Ehrhardt

  3. Inst. Medizinische Informatik, RWTH Aachen, Pauwelsstr. 30, Aachen, 52074, Germany

    Thomas M. Deserno

  4. Abt. Med./Biol.Inform./H0100, Deutsches Krebsforschungzentrum (DKFZ), Im Neuenheimer Feld 280, Heidelberg, 69120, Germany

    Hans-Peter Meinzer

  5. Charité Campus Benjamin Franklin, Inst. Medizinische Informatik,, Universitätsklinikum Berlin, Hindenburgdamm 30, Berlin, 12200, Berlin, Germany

    Thomas Tolxdorff

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© 2011 Springer-Verlag Berlin Heidelberg

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Held, C., Wenzel, J., Ralf, P., Lang, R., Wittenberg, T. (2011). Segmentierung von Makrophagen in Fluoreszenzbildern mittels Fast Marching Level Set Verfahren. In: Handels, H., Ehrhardt, J., Deserno, T., Meinzer, HP., Tolxdorff, T. (eds) Bildverarbeitung für die Medizin 2011. Informatik aktuell. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-642-19335-4_28

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