Abstract
Allele frequency shifts can result from adaptation or selection and indicate strategies for coping with stress scenarios. Observing these requires genotyping of hundreds of lines individually or in a pooled sample–both rather costly, especially for species with large genomes. Constructing virtual haplotypes from SNP allele frequencies can drastically reduce genotyping time and costs in pooled sampling. Further, we validated three commonly used genotyping strategies for poolseq in crop species.
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Literatur
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Jens Léon
Studium der Agrarwissenschaften an der Universität zu Kiel mit anschließender Promotion 1985 in Pflanzenzüchtung unter Anleitung von Prof. Dr. M. Hühn, Habilitation daselbst im Jahr 1992. Bis 1996 Hochschulassistent an der Universität zu Kiel. Seit 1996 Professor für Pflanzenzüchtung an der Universität Bonn.
Agim Ballvora
Studium der Biologie. Wissenschaftlicher Mitarbeiter in der Pflanzengenetik am Max-Planck-Institut für Pflanzenzüchtungsforschung, Köln. 1995 Promotion. Anschließend Postdoktorand am Institut des Sciences Vegetale, CNRS, Frankreich und am Max-Planck-Institut für Pflanzenzüchtungsforschung. Seit 2010 Wissenschaftlicher Mitarbeiter beim INRES-Pflanzenzüchtung an der Universität Bonn.
Michael Schneider
2011–2016 Studium der Agrar- und Nutzpflanzenwissenschaften an der Universität Bonn. Dort bis 2020 Promotion in der Pflanzenzüchtung unter Anleitung von Prof. Dr. J. Léon. 2020–2022 Postdoktorand an der Universität Düsseldorf in der quantitativen Genetik bei Prof Dr. B. Stich. Folgend angestellt am Forschungsinstitut für biologischen Landbau (FiBL) im Department Nutzpflanzenwissenschaften, mit Fokus auf Züchtung für den organischen Anbau.
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Léon, J., Ballvora, A. & Schneider, M. Allelfrequenzschätzungen machen historische Selektionsereignisse sichtbar. Biospektrum 29, 470–474 (2023). https://doi.org/10.1007/s12268-023-1993-9
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