Abstract
Biofilms are the most abundant growth form of microorganisms in nature. To exploit these living systems for applications in biotechnology, we have developed a microfluidic cultivation platform with an integrated automatic sampling robot that enables the characterization of biofilms with high spatiotemporal resolution. Moreover, in situ imaging and anoxic or gas-consumption based cultivation can be applied. Biocatalytic productivity can be assessed using a spectrum of analytical technologies.
Article PDF
Similar content being viewed by others
Avoid common mistakes on your manuscript.
Literatur
Stoodley P, Sauer K, Davies DG et al. (2002) Biofilms as complex differentiated communities. Annu Rev Microbiol 56:187–209
Halan B, Buehler K, Schmid A (2012) Biofilms as living catalysts in continuous chemical syntheses. Trends Biotechnol 30:453–465
Hansen SH, Kabbeck T, Radtke CP et al. (2019) Machine-assisted cultivation and analysis of biofilms. Sci Rep 9:8933
Pamp SJ, Sternberg C, Tolker-Nielsen T (2009) Insight into the microbial multicellular lifestyle via flow-cell technology and confocal microscopy. Cytom Part A 75A:90–103
Wagner M, Horn H (2017) Optical coherence tomography in biofilm research: a comprehensive review. Biotechnol Bioeng 114:1386–1402.
Funding
Open Access funding provided by Projekt DEAL.
Author information
Authors and Affiliations
Corresponding author
Additional information
Christof M. Niemeyer 1984–1989 Chemiestudium an der Universität Marburg. 1990–1992 Promotion In der Organischen Chemie bei Prof. Dr. M. T. Reetz, Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Mühlheim an der Ruhr. 1992–1994 Postdoktorand bei Prof. Dr. R. W. Read, University of New South Wales, Sydney, Australien, und bei Prof. Dr. C. R. Cantor, Center for Advanced Biotechnology, Boston University, USA. 1994–2002 Habilitation an der Universität Bremen. 2002–2012 Professur an der TU Dortmund. Seit 2012 Professor für Chemische Biologie und Direktor des Instituts für Biologische Grenzflächen (IBG-1) am Karlsruher Institut für Technologie (KIT), Eggenstein-Leopoldshafen.
Johannes Gescher 1996–2001 Biologiestudium an der Universität Freiburg. 2001–2005 Promotion. 2005–2006 Postdoc im Labor von Prof. Dr. A. M. Spormann an der Stanford University, USA. 2008–2011 Vertretungsprofessor für Mikrobiologie der Universität Freiburg. Seit 2011 Professor für Angewandte Biologie am Institut für angewandte Biowissenschaften (IAB) am Karlsruher Institut für Technologie (KIT), Karlsruhe.
Phillip Lemke 2012–2019 Bachelor- und Masterstudiengang Bioingenieurwesen am Karlsruher Institut für Technologie (KIT). Seit 2019 Doktorand in der Arbeitsgruppe Niemeyer am Institut für Biologische Grenzflächen (IBG-1), Eggenstein-Leopoldshafen.
Edina Klein 2013–2016 Bachelorstudium Biologie an der Universität Leipzig. 2016–2018 Masterstudium Biologie am Karlsruher Institut für Technologie (KIT). Seit 2019 Promotion in der Abteilung für Angewandte Biologie in der Arbeitsgruppe Gescher am Institut für angewandte Biowissenschaften (IAB), Karlsruhe.
Rights and permissions
Dieser Artikel wird unter der Creative Commons Namensnennung 4.0 International Lizenz veröffentlicht, welche die Nutzung, Vervielfältigung, Bearbeitung, Verbreitung und Wiedergabe in jeglichem Medium und Format erlaubt, sofern Sie den/die ursprünglichen Autor(en) und die Quelle ordnungsgemäß nennen, einen Link zur Creative Commons Lizenz beifügen und angeben, ob Änderungen vorgenommen wurden. Die in diesem Artikel enthaltenen Bilder und sonstiges Drittmaterial unterliegen ebenfalls der genannten Creative Commons Lizenz, sofern sich aus der Abbildungslegende nichts anderes ergibt. Sofern das betreffende Material nicht unter der genannten Creative Commons Lizenz steht und die betreffende Handlung nicht nach gesetzlichen Vorschriften erlaubt ist, ist für die oben aufgeführten Weiterverwendungen des Materials die Einwilligung des jeweiligen Rechteinhabers einzuholen. Weitere Details zur Lizenz entnehmen Sie bitte der Lizenzinformation auf http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.de.
About this article
Cite this article
Lemke, P., Klein, E., Gescher, J. et al. Kultivierung und Analyse von Biofilmen durch automatisierte Mikrosysteme. Biospektrum 26, 167–169 (2020). https://doi.org/10.1007/s12268-020-1346-x
Published:
Issue Date:
DOI: https://doi.org/10.1007/s12268-020-1346-x