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Online-Datenbanken und systematische Metaanalysen komplex-genetischer Erkrankungen

Online databases and systematic meta-analyses of genetically complex diseases

Zusammenfassung

Die Suszeptibilität komplex-genetischer Erkrankungen wird durch eine unbekannte Anzahl genetischer Faktoren bestimmt. In den letzten Jahrzehnten sind Hunderte von Suszeptibilitätsloci für die Alzheimer-Krankheit (AD), das idiopathische Parkinson-Syndrom (PD), Schizophrenie (SZ) und multiple Sklerose (MS) beschrieben worden. Diese schwierig zu überschauende Datenlage für jede dieser Erkrankungen wird kompliziert durch die ansteigende Zahl genomweiter Assoziationsstudien. Um die Evaluation und Interpretation der Ergebnisse zu erleichtern, haben wir Internet-Datenbanken für genetische Assoziationsstudien in AD, PD, SZ und MS generiert. Neben einer detailierten Synopse aller verfügbaren Studien bieten die Datenbanken allel-basierte Metaanalysen der Polymorphismen, zu denen ausreichende Daten vorliegen. In diesem Review stellen wir anhand der Datenbanken für AD (AlzGene) und PD (PDGene) den Hintergrund und die Implikationen dieses Ansatzes vor.

Abstract

Susceptibility to genetically complex disorders is determined by an unknown number of genetic determinants, and decades of intensive research have yielded hundreds of such potential susceptibility loci for Alzheimer’s disease (AD), Parkinson’s disease (PD), schizophrenia (SZ), and multiple sclerosis (MS). The results of genome-wide association studies are now adding to an already vast and complicated body of data. To facilitate the evaluation and interpretation of these findings, we have recently created online databases for genetic association studies in AD, PD, SZ, and MS. In addition to providing detailed summaries for each eligible study, the databases present the results of allele-based meta-analyses for all polymorphisms with sufficient genotype data. In this review, we discuss the background and implications of the database approach developed by our group, using current findings from the AD (AlzGene) and PD (PDGene) databases as examples.

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Abb. 1
Abb. 2

Abbreviations

AD:

Alzheimer-Krankheit

APOE:

„apolipoprotein E“ (Gen-Name)

BDNF:

„brain-derived neurotrophic factor“ (Gen-Name)

CLU:

„clusterin“ (Gen-Name)

CR1:

„complement component (3b/4b) receptor 1“ (Gen-Name)

GBA:

„glucosidase, beta, acid“ (Gen-Name)

GWAS:

Genomweite Assoziationsstudie

LRRK2:

„leucine-rich repeat kinase 2“ (Gen-Name)

MAPT:

„microtubule-associated protein tau“ (Gen-Name)

MS:

Multiple Sklerose

OR:

Odds Ratio (Effektstärke)

PD:

Idiopathisches Parkinson-Syndrom

PICALM:

„phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein“ (Gen-Name)

SNCA:

„alpha-synuclein“ (Gen-Name)

SZ:

Schizophrenie

TPRG1:

„tumor protein p63 regulated 1“ (Gen-Name)

ε4Allel:

Epsilon-4-Allel

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Danksagung

Unser Dank gilt allen Mitarbeitern und Kollaborateuren, die zur Erstellung und Aktualisierung der besprochenen Datenbanken beigetragen haben (s. hierzu die „Credits-Sektionen“ auf den Internetseiten der jeweiligen Datenbanken), insbesondere den Mitarbeitern der Alzheimer- und Schizophrenia-Research-Foren, die die Datenbanken im Internet darstellen.

Interessenkonflikt

Der korrespondierende Autor weist auf folgende Beziehung(en) hin: AlzGene wird gefördert durch den Cure Alzheimer Fund (Waltham, USA), PDGene durch die Michael J. Fox Foundation for Research in Parkinson’s disease (New York, USA), und SZGene durch die National Alliance on Research in Schizophrenia and Depression (NARSAD; New York, USA), alle Förderungen jeweils an L.B. als Principal Investigator.

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Lill, C., Bertram, L. Online-Datenbanken und systematische Metaanalysen komplex-genetischer Erkrankungen. medgen 22, 235–241 (2010). https://doi.org/10.1007/s11825-010-0225-0

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Schlüsselwörter

  • Neuropsychiatrische Erkrankungen
  • Alzheimer-Krankheit
  • Idiopathisches Parkinson-Syndrom
  • Genetische Assoziation
  • Metaanalyse

Keywords

  • Neuropsychiatric traits
  • Alzheimer’s disease
  • Idiopathic Parkinson’s disease
  • Genetic association
  • Meta-analysis