Zusammenfassung
Die Realtime-PCR ist ein quantifizierendes Nachweisverfahren und stellt deshalb eine Weiterentwicklung der konventionellen, rein qualitativen PCR dar. Mittlerweile wird sie als schnelle, sensitive und spezifische Methode auch beim Nachweis von Pflanzenpathogenen genutzt. Im vorliegenden Beitrag ist grundlegendes Wissen zum Thema „Realtime-PCR“ zusammengetragen. Zudem wird die an der Bayerischen Landesanstalt für Landwirtschaft (LfL) etablierte Methode zum Nachweis der Erreger der Bakteriellen Ringfäule der Kartoffel und der Schleimkrankheit vorgestellt, um Diagnoselabore zu unterstützen, die das Verfahren nutzen möchten.
Abstract
Realtime-PCR as a quantitative nucleic acid amplification method is an improvement of conventional PCR, which only provides qualitative results. In the meantime Realtime-PCR, which is fast, sensitive and specific as well, is increasingly used for detection of plant pathogens. In this report basic knowledge about Realtime-PCR is presented. Furthermore the method established at the Bavarian State Research Center for Agriculture (LfL) for detection of Bacterial Ring Rot and Brown Rot Pathogens of potato is described to assist diagnostic laboratories which want to apply this technique.
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Literatur
Anonymus (2006a) Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus. EPPO Bulletin 36(1):99–109
Anonymus (2006b) Richtlinie 2006/56/EG der Kommission vom 12. Juni 2006 zur Änderung der Anhänge der Richtlinie 93/85/ EWG des Rates zur Bekämpfung der bakteriellen Ringfäule der Kartoffel. L 182/1–L 182/43
Bach H-J, Jessen I, Schloter M, Munch JC (2003) A Taqman-PCR protocol for quantification and differentiation of the phytopathogenic Clavibacter michiganensis subspecies. J Microbiol Meth 52:85–91
Bauer A, Seigner L, Büttner P, Tischner H (2006) Epidemiologische Untersuchungen von Fusarium an Weizen mit Hilfe der Realtime-PCR. Mitt Biol Bundesanst Land-Forstwirtsch 400:65
Bauer A, Seigner L, Büttner P, Tischner H (2007) Field studies of FHB in wheat development and mycotoxin production using quantitative PCR and DON-ELISA. Conference abstracts 29th Mycotoxin-Workshop, Fellbach, Germany, 14–16th May 2007:32
Kaemmerer D, Kappen M, Friedrich-Zorn M, Seigner L (2006) Bakterielle Ringfäule der Kartoffel. Kartoffelbau 11:504–508
Schaad W, Berthier-Schaad Y, Sechler A, Knorr D (1999) Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by BIO-PCR and an automated real-time fluorescence detection system. Plant Dis 83(12):1095–1100
Seigner L (1997) Der Nachweis von Burkholderia (Pseudomonas solanacearum) mit der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) – Vergleich verschiedener DNA-Extraktionsmethoden. Ges Pfl 49:37–42
Weller SA, Elphinstone JG, Smith NC, Boonham N, Stead DE (2000) Detection of Ralstonia solanacearum strains with a quantitative, multiplex, real-time, fluorogenic PCR (Taqman) assay. Appl Environ Microbiol 66(7):2853–2858
Danksagung
Unser Dank gilt Frau Christine Huber für ihre sehr gute technische Assistenz, ihr Engagement bei der Etablierung der Realtime-PCR und den späteren Untersuchungen sowie Frau Margarete Kistler, Frau Dorothea Köhler und den Mitarbeiterinnen von Herrn Dr. Poschenrieder für ihre wertvolle Mitarbeit. Dr. Petra Müller, BBA Kleinmachnow, sei gedankt für die Organisation, Koordination und Auswertung des deutschlandweiten Ringtests zum Nachweis von Cms und Rs. Dem Bayerischen Staatsministerium für Landwirtschaft und Forsten danken wir für die finanzielle Förderung der Arbeiten.
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Seigner, L., Kaemmerer, D. & Kappen, M. Realtime-PCR zum Nachweis von Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus und Ralstonia solanacearum – Grundlagen, Methode und praktische Hinweise. Gesunde Pflanzen 59, 101–106 (2007). https://doi.org/10.1007/s10343-007-0159-x
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