Komparative genomische Hybridisierung in der Pathologie Eine neue molekularzytogenetische Methode*

Zusammenfassung

Die komparative genomische Hybridisierung (CGH) ist eine neu entwickelte zytogenetische Methode, die auf einer Kombination von Fluoreszenzmikroskopie und digitaler Bildanalyse beruht. Grundlage stellt die Hybridisierung eines Gemisches aus zu testender und normaler DNA auf gesunde Metaphasechromosomen dar, deren vergleichende (komparative) Analyse die Identifizierung aller unbalancierten chromosomalen Aberrationen der Test-DNA in einem Versuchsansatz erlaubt. Die somit detektierten DNA-Gewinne oder DNA-Verluste auf chromosomaler und subchromosomaler Ebene stellen ein Spiegelbild für eine etwaige Amplifikation eines Onkogens oder den Verlust eines Tumorsuppressorgens dar. Da die CGH mit isolierter DNA sowohl aus formalinfixiertem als auch aus frischem Gewebe/Zellen durchgeführt werden kann, stellt sie für den Pathologen und Zytologen gleichermaßen ein effektives Werkzeug bei der erweiterten genomischen Analyse von Tumoren und anderen genetisch alterierten Geweben dar. Obwohl die CGH bislang ausschließlich in der Forschung eingesetzt wird, ist mit ihrer Anwendung als Routinemethode in der pathologisch-anatomischen Diagnostik bereits in naher Zukunft zu rechnen.

Summary

Comparative genomic hybridisation (CGH) is a new cytogenetic method, which is based on a combination of fluorescence microscopy and digital image analysis. The molecular genetic basis is the hybridization of a mixture of fluorescein labeled test-DNA and reference-DNA on normal metaphase chromosomes. Comparative analysis allows the identification of all unbalanced chromosomal aberrations of the test-DNA in a single experimental step. The resulting DNA gains or DNA losses on the chromosomal or subchromosomal level mirror possible amplifications of oncogenes or losses of suppress orgenes. As CGH can be performed with genomic DNA of formalin-fixed and fresh-frozen tissue or cells, this new method is a very effective tool for pathologists and cytologists in the extended genomic screening of tumors and genetically altered tissues. Despite CGH analysis at present is restricted to research applications; its widespread dissemination as a routine method in diagnostic pathology can be expected in the near future.