Der Urologe

, Volume 56, Issue 6, pp 711–719 | Cite as

Neue mikrobiologische Techniken

Leitthema

Zusammenfassung

Die mikrobiologische Diagnostik erlebte in den letzten Jahren v. a. durch neue oder optimierte Techniken im Bereich der molekularen Diagnostik einen revolutionären Entwicklungsschub. Die klassische kulturbasierte Diagnostik stellt zwar in vielen Bereichen immer noch den Goldstandard dar, für eine größere Geschwindigkeit und bessere Qualität wird sie jedoch durch molekulare und automatisierte Techniken ergänzt. Dazu zählen in erster Linie molekulare Verfahren wie quantitative Polymerasekettenreaktionen oder Hybridisierungstechniken. Diese bewähren sich v. a. für den direkten Erregernachweis aus Patientenproben sowie zum Nachweis von nicht oder nur schwer anzüchtbaren Erregern. Weitere Techniken wie sequenzierungsbasierte Verfahren sind in der urologischen Diagnostik noch eher experimentell, könnten jedoch mit weiterer technischer Entwicklung und sinkenden Kosten in Zukunft an Gewicht gewinnen. Für die bakterielle Identifikation sind mittlerweile in mikrobiologischen Laboren massenspektrometrische Verfahren Standard in Europa. Daneben gibt es viele Entwicklungen, die eine Beschleunigung auch der Resistenztestung von Patientenisolaten zum Ziel haben, um die antimikrobielle Therapie im Zeitalter stetig steigender antimikrobieller Resistenzen weiterhin wirkungsvoll steuern zu können. Die sich rasch entwickelnden neuen Techniken werden in modernen Laboratorien oftmals für den Kliniker unbemerkt umgesetzt und bieten eine breitere und bessere Diagnostik als bisher. Es ist auch in Zukunft mit weiteren Verbesserungen zu rechnen, und gerade im Hinblick auf immer knappere finanzielle Ressourcen und erhöhte Antibiotikaresistenzraten ist ein effektiver Dialog zwischen Labor und Kliniker für die optimale Therapie des Patienten essentiell.

Schlüsselwörter

Harnwegsinfekt Polymerasekettenreaktionen Hybridisierung Massenspektrometrie Sequenzierung 

New microbiological techniques

Abstract

Microbiological diagnostic procedures have changed rapidly in recent years. This is especially true in the field of molecular diagnostics. Classical culture-based techniques are still the gold standard in many areas; however, they are already complemented by automated and also molecular techniques to guarantee faster and better quality results. The most commonly used techniques include real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) based systems and nucleic acid hybridization. These procedures are used most powerfully from direct patient samples or in assays to detect the presence of nonculturable or fastidious organisms. Further techniques such as DNA sequencing are not yet used routinely for urological samples and can be considered experimental. However, in conjunction with dropping prices and further technical developments, these techniques promise to be used much more in the near future. Regarding bacterial identification from culture, mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has become the technique of choice in recent years especially in Europe. It has tremendously shortened the time to result. This is now going to be extended to antibiotic susceptibility testing. This is of paramount importance in view of ever rising antimicrobial resistance rates. Techniques described in this review offer a faster and better microbiological diagnosis. Such continuous improvements are critical especially in times of cost pressure and rising antimicrobial resistance rates. It is in our interest to provide the best possible care for patients and in this regard a good and effective communication between the laboratory and the clinician is of vital importance.

Keywords

Urinary tract infection Polymerase chain reaction Hybridization Mass spectrometry Sequencing 

Notes

Einhaltung ethischer Richtlinien

Interessenkonflikt

S. Schubert, A. Wieser und G. Bonkat geben an, dass kein Interessenkonflikt besteht.

Dieser Beitrag beinhaltet keine von den Autoren durchgeführten Studien an Menschen oder Tieren.

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Copyright information

© Springer Medizin Verlag GmbH 2017

Authors and Affiliations

  1. 1.Max von Pettenkofer-Institut für Hygiene und Medizinische MikrobiologieLudwig-Maximilians-Universität MünchenMünchenDeutschland
  2. 2.Abteilung für Infektions- und Tropenmedizin der LMUMünchenDeutschland
  3. 3.Deutsches Zentrum für Infektionsforschung (DZIF), Standort MünchenMünchenDeutschland
  4. 4.alta uro AGBaselSchweiz

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