Summary
Passport data of 55,369 accessions from 35 barley collections in 26 countries are stored in the European Barley Database (EBDB) of the European Cooperative Programme for the Conservation and Exchange of Crop Genetic Resources (ECP/GR) which is maintained at the Zentralinstitut für Genetik und Kulturpflanzenforschung at Gatersleben, German Democratic Republic. A catalogue, the European Barley List, was published in 1987. The database runs on an 8 bit microcomputer under the CP/M operating system and the database management system dBASE II. The objectives of the EBDB are outlined, and the origin of the data is described. The definitions of the 23 passport descriptors are given, and problems of their standardization and the development of unified acronym systems are discussed. Surveys of the geographical distribution and the botanical composition of the material are presented. Detailed tables list the origin countries of the material, the most frequent botanical varieties inHordeum vulgare, and the 33 wild species of the genusHordeum which are represented by 2785 accessions. The frequencies of certain morphological character combinations inH. vulgare are calculated from the frequencies of the corresponding infraspecific taxa. The projected development of the database includes the identification of duplicates and of geographical gaps in European collections. The usefulness of a KWIC (Key Word In Context) index as a new tool for the identification of duplicates in plant genetic resources databases is illustrated by two examples. The services of the EBDB and computer-readable copies of the database are offered to potential users.
Zusammenfassung
Paßportdaten von 55369 Sippen genetischer Ressourcen aus 35 Gerstenkollektionen in 26 Ländern sind in der Europäischen Gerstendatenbank (European Barley Database, EBDB) des European Cooperative Programme for the Conservation and Exchange of Crop Genetic Resources (ECP/GR) gespeichert, die am Zentralinstitut für Genetik und Kulturpflanzenforschung Gatersleben geführt wird. Ein Katalog, die Europäische Gerstenliste (European Barley List), wurde 1987 publiziert. Die Datenbank ist auf einem 8-bit-Mikrocomputer unter dem Betriebssystem CP/M und dem Datenbankverwaltungssystem dBASE II installiert. Die Aufgaben der Datenbank werden genannt, und die Herkunft der Daten wird beschrieben. Die Definitionen der 23 Paßportdeskriptoren sind angeführt, und Probleme ihrer Standardisierung und der Entwicklung einheitlicher Abkürzungssysteme werden diskutiert. Aus den vorhandenen Daten werden Übersichten über die geografische Verbreitung und die botanische Zusammensetzung des Materials abgeleitet. Die Ursprungsländer, die häufigsten Varietäten vonHordeum vulgare und die 33 Wildarten der GattungHordeum, von denen insgesamt 2785 Sippen in der Datenbank vorhanden sind, sind in ausführlichen Tabellen zusammengestellt. Die Häufigkeiten einiger Kombinationen morphologischer Merkmale beiH. vulgare wurden anhand der Häufigkeiten der entsprechenden infraspezifischen Taxa ermittelt. Zu den geplanten weiteren Aktivitäten der Datenbank gehören die Identifizierung von Duplikaten und die Ermittlung derjenigen Länder und Gebiete, die in europäischen Gerstenkollektionen zu schwach repräsentiert sind. Die Nützlichkeit eines sog. KWIC-Index (Key Word In Context) als neues Hilfsmittel zur Auffindung von Duplikaten in internationalen Datenbanken genetischer Pflanzenressourcen ist anhand von zwei Beispielen dargestellt. Dienstleistungen der Datenbank und computerlesbare Kopien der Dateien werden potentiellen Nutzern angeboten.
Краткое содержание
Паспортные данные 55369 образцов гепетпческпх ресурсов из 35 коллекций ячменей 26 стран хранятея в Европейском банке данных ячменя (European Barley Database, EBDB) Европейской кооператпвной программы по сохранению и обмену генетпческих ресурсов (ЕКП/ГР), который ведется в Центральном институте генетики п пссдедованпя культурных растений, в Гатерслебене. В 1987 году был опубликован каталог — Европейский список ячменя (European Barley List). Банк данных базируется на 8-бптовой микроВМ с операционной системой СР/М и пакетМ программ dBASE II. Сообщаются задачи банка данных, описывается происхождение данных. Приводится определение 23-х паспортных дескрипторов п обсуждаются проблемы по их стандартпэацип и раэвипп единой системы сокращений. На основанпп пмеющихся данных дается обозрение о географпческом распространенип п ботаническом составе матерпала. Составлены подробные таблпцы страп пропсхожденпя наиболее частых разновпдностейHordeum vulgare п 33-х дпких впдов родаHordeum, пз которых, в общей сложностп, 2785 овразцов хранятся в банке данных. На основании повторяемостп соответствующпх внутривпдовых таксонов были установлены частоты отдельных комбпнаций морфологических признаков уH. vulgare. К дальнейшим запланированным работам банка данных относятся идентификация дублпкатов п выяснение тех стран и областей, которые очень слабо представлены в европейскпх коллекциях ячменей. На двух прпмерах показана важность, так называемого, КСВК-индекса (ключевое слово в контексте) как нового вспомогательного средства для нахождения дубликатов в международных банках данных генетических растптельных ресурсов. Потенциальным потребителям предлагаются услугп банка данных, а также считываемые с помощью микроЭВМ коппи масспва данных.
Similar content being viewed by others
Literature
Anon., 1982: Country abbreviations for use with IBPGR descriptors. — Plant Genetic Resources Newsletter49, 45–48.
Arias, G., L. Reiner, A. Penger andA. Mangstl, 1983: Directory of Barley Cultivars and Lines. — Eugen Ulmer, Stuttgart.
Barron, D. W., 1984: Current database design-the user's view. — In:R. Allkin andF. A. Bisby (eds.), Databases in Systematics, pp. 35–42. — Acad. Press, London, etc.
Baum, B. R., 1970: The problem of classifying cultivars with special emphasis on oat(Avena) cultivars. — Canad. J. Bot.48, 1373–1381.
——, 1986: International registration of cultivars with emphasis on barley: procedures and methods of producing a register. — Acta Hortic.182, 237–250.
--,L. G. Bailey andB. K. Thompson, 1985: Barley Register. — Canada Governm. Publ. Ctr., Cat. No. A53-1783/1985.
Blixt, S., 1985: Final report, preparation of the European Barley List of unique accessions. — 80 pp. (unpublished).
von Bothmer, R., N. Jacobsen, andR. B. Jörgensen, 1982: Kornsläktet och användning av vilda kornarter i växtförädling. — Sveriges Utsädesförenings Tidskrift92, 93–106.
Chapman, C., 1987: Barley genetic resources, the status of collection and conservation. — In: Barley Genetics V, Proc. 5th Internat. Barley Genetics Sympos., Okayama, Japan, October 1986 pp. 43–49.
Cvelev, N. N., 1976: Grasses of the U.S.S.R. — Nauka, Leningrad (Russian).
FAO/UNDP, 1980: FAO/UNDP/Governments consultation on the European Cooperative Programme for the Conservation and Exchange of Genetic Resources for Plant Breeding. — Food and Agriculture Organization, Rome.
Freeston, M. W., 1984: The implementation of databases on small computers. — In:R. Allkin andF. A. Bisby (eds.), Databases in Systematics, pp. 43–52. — Acad. Press, London, etc.
Gandiljan, P. A., 1980: Determiner to the Wheats,Aegilopses, Ryes and Barleys. — Izdatel'stvo AN Armjanskoj SSR, Erevan (Russian, English summary).
IBPGR, 1982: Barley Descriptors. — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
Jain, S. K., C. O. Qualset, G. M. Bhatt, andK. K. Wu, 1975: Geographical patterns of phenotypic diversity in a world collection of durum wheats. — Crop Sci.15, 700–704.
Knüpffer, H., 1983: Computer in Genbanken — eine Übersicht. — Kulturpflanze31, 77–143.
—— (compiler), 1986: European Barley List (Draft). — Zentralinst. Genetik u. Kulturpflanzenforsch., Gatersleben, xxx + 670 pp. (unpublished)
Knüpffer, H. (compiler), 1987a: European Barley List. Vol. 1, Introduction. — Zentralinst. Genetik u. Kulturpflanzenforsch., Gatersleben, 82 pp.
—— (compiler), 1987b: European Barley List. Vol. 2. — Zentralinst. Genetik u. Kulturpflanzenforsch., Gatersleben, 829 pp.
--, 1989: Identification of duplicates in international databases of plant genetic resources. — Plant Genetic Resources Newsletter (in preparation).
--,C. O. Lehmann, andF. Scholz, 1987: Barley genetic resources in European genebanks — the European Barley Database. — In: Barley Genetics V, Proc. 5th Internat. Barley Genetics Sympos., Okayama, Japan, October 1986, pp. 75–82.
Lehmann, C. O., andS. Blixt, 1984: Artificial infraspecific classification in relation to phenotypic manifestation of certain genes inPisum. — Agri Hortique Genetica42, 49–74.
Mansfeld, R., 1950: Das morphologische System der Saatgerste,Hordeum vulgare L. s. l. — Züchter20, 8–24.
Perret, P. M., 1985: European Programme for Conservation and Exchange of Crop Genetic Resources. — Plant Genetic Resources Newsletter61, 5–12.
Sarasan, L., andA. M. Neuner, 1983: Museum Collections and Computers. — Assoc. Systemat. Collections, Lawrence, Kansas.
Schultze-Motel, J., 1986: Gramineae (Cynosurus bisPaspalum). — In:Schultze-Motel, J. (ed.),Rudolf Mansfelds Verzeichnis landwirtschaftlicher und gärtnerischer Kulturpflanzen (ohne Zierpflanzen), 2. Auflage, Bd.3, S. 1415–1536. — Akademie-Verlag, Berlin.
Seidewitz, L. (ed.), 1986: European Catalogue ofAvena. 2nd ed. — Inst. Pflanzenbau u. Pflanzenzücht., Braunschweig; Internat. Board Plant Genetic Resources, Rome. xxxv+262 pp.
Serwiński, J., et al. (compilers), 1987: List of Institutions-Genebanks, Donors, Collecting Institutions, etc. — Computer printout of 5-Jan-87. IHAR Radzików, Poland (unpublished).
Tremblay, J. P., andP. G. Sorenson, 1976: An Introduction to Data Structures with Applications. — McGraw-Hill Book Co., New York, etc. (Russ. translation: Moskva, 1982).
UNDP/IBPGR European Cooperative Programme for the Conservation and Exchange of Crop Genetic Resources, 1983: Report of a Working Group on Barley. — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
——/—— ——, 1984: Report of a Workshop on Exchange of Information. — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
——/—— ——, 1985: Report of a Barley Workshop. — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
——/—— ——, 1986a: Report of a Working Group on Barley (Second Meeting). — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
——/—— ——, 1986b: Report of a Working Group on Avena (Second Meeting). — Internat. Board for Plant Genetic Resources, Rome.
Valente Soares, F., andT. Vanderborght, 1986: Analysis of plant genetic resources data forPhaseolus vulgaris L. Final Report. — Report AGPG: IBPGR/86/37, IBPGR-Gembloux Project, Internat. Board for Plant for Plant Genetic Resources, Rome, 41 pp.
Author information
Authors and Affiliations
Rights and permissions
About this article
Cite this article
Knüpffer, H. The European barley database of the ECP/GR: an introduction. Die Kulturpflanze 36, 135–162 (1988). https://doi.org/10.1007/BF01986957
Issue Date:
DOI: https://doi.org/10.1007/BF01986957