Synthesis, crystal structure and conformation of N-acetyl-C^α,α-diethylglycine-N′-methylamide

Summary

Synthesis and X-ray structure analysis of N-acetyl-^α,α-diethylglycine-N′-methylamide [CH₃-Co-NH-C(C₂H₅)₂-CO-NHCH₃] are described. The compound was obtained from the corresponding N-acetyl derivative [CH₃-CO-NH-C(C₂H₅)₂-COOH] through the mixed anhydride procedure. It crystallizes as monohydrate (C₉H₁₈N₂O₂·H₂O) in space group P2₁/c,a=7.139(1),b=11.823(2),c=15.778(3) Å, β=122.23(1)°,V=1126.53 ų,D _m=1.20 Mgm⁻³ (room temperature),R=0.046 for 1523 reflections. The crystal packing is dominated by two strong hydrogen bonds between the water molecule and two carbonyl oxygen atoms and two weak H-bonds to two amide-N-atoms of symmetry-equivalent molecules. The molecular conformation is closer to a 3₁₀-helix then ana-helix.

Zusammenfassung

Es wird über Synthese und die röntgenographische Strukturbestimmung von N-Acetyl-^α,α-diethylglycin-N′-methyl-amid [CH₃-CO-NH-C(C₂H₅)₂-CO-NH-CH₃] berichtet. Die Verbindung wurde unter Anwendung der Methode der gemischten Anhydride aus dem entsprechenden N-Acetylderivat [CH₃-CO-NH-C(C₂H₅)₂-COOH] erhalten. Sie kristallisiert als Monohydrat (C₉H₁₈N₂O₂·H₂O) in der Raumgruppe P2₁/c mita=7.139(1),b=11.823(2),c=15.778(3) Å, β=122.23(1)°,V=1126.53 ų,D _m=1.20 Mgm⁻³,D _x=1.204 Mgm⁻³ (Raumtemperatur).R=0.046 für 1523 Reflexe. Die Kristallpackung ist dominiert durch zwei starke H-Brücken vom Wassermolekül zu zwei Carbonylsauerstoffatomen sowie zwei schwachen H-Brücken zu zwei Amid-N-atomen symmetrieequivalenter Moleküle. Die Konformation des Peptidgerüstes ist näher einer 3₁₀ als einera-Helix.