Abstract
The human gut microbiota harbors untapped potential for biotechnological applications. Within the phylum of Bacteroidota, Phocaeicola vulgatus stands out as a promising candidate for sustainable production of key platform chemicals like succinate. However, genetic engineering of Phocaeicola sp. remains challenging due to its intricate molecular landscape. This study lays the groundwork for manipulating the central carbon pathways in Phocaeicola vulgatus, offering insights into overcoming genetic hurdles for increased succinate yields.
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Literatur
Wexler AG, Goodman AL (2017) An insider’s perspective: Bacteroides as a window into the microbiome. Nat Microbiol 2: 1–11
King CH, Desai H, Sylvetsky AC et al. (2019) Baseline human gut microbiota profile in healthy people and standard reporting template. PloS One 14: e0206484
Mimee M, Tucker AC, Voigt CA et al. (2015) Programming a Human Commensal Bacterium, Bacteroides thetaiotaomicron, to Sense and Respond to Stimuli in the Murine Gut Microbiota. Cell Syst 1: 62–71
Jones KR, Belvin BR, Macrina FL et al. (2020) Sequence and characterization of shuttle vectors for molecular cloning in Porphyromonas, Bacteroides and related bacteria. Mol Oral Microbiol 35: 181–191
Lück R, Deppenmeier U (2022) Genetic tools for the redirection of the central carbon flow towards the production of lactate in the human gut bacterium Phocaeicola (Bacteroides) vulgatus. Appl Microbiol Biotechnol 106: 1211–1225
Neff A, Lück R, Deppenmeier U (2023) Expanding the repertoire of counterselection markers for markerless gene deletion in the human gut bacterium Phocaeicola vulgatus. Anaerobe 81: 102742
Saxena RK, Saran S, Isar J et al. (2017) Production and applications of succinic acid. Curr Dev Biotechnol Bioeng 27: 601–630
Zeikus JG, Jain MK, Elankovan P (1999) Biotechnology of succinic acid production and markets for derived industrial products. Appl Microbiol Biotechnol 51: 545–552
Dai Z, Guo F, Zhang S et al. (2020) Bio-based succinic acid: an overview of strain development, substrate utilization, and downstream purification. Biofpr 14: 965–985
Funding
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Uwe Deppenmeier
1982–1991 Studium der Biologie und Promotion, Universität Göttingen. 1991–1992 Postdoc an der University of California, Los Angeles. 1992–2003 Wiss. Mitarbeiter und Habilitation im Institut für Mikrobiologie, Universität Göttingen. 2003–2007 Associate Professor an der University of Wisconsin, USA. Seit 2007 Professor für Angewandte Mikrobiologie am Institut für Mikrobiologie & Biotechnologie, Universität Bonn.
André Neff
2014–2019 Biologiestudium an der Universität Bonn. Dort bis 2023 Promotion im Bereich Mikrobiologie unter Anleitung von Prof. Dr. U. Deppenmeier. Seit 2023 Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Mikrobiologie und Biotechnologie, Universität Bonn.
Rebecca Lück
2014–2019 Biologiestudium an der Universität Bonn. Dort bis 2023 Promotion im Bereich Mikrobiologie unter Anleitung von Prof. Dr. U. Deppenmeier. Seit 2023 Wissenschaftliche Mitarbeiterin im Institut für den Schutz terrestrischer Infrastrukturen, Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt (DLR), und am Institut für Sicherheitsforschung (ISF), Hochschule Bonn-Rhein Sieg.
Mélanie Gindt
2015–2021 Biologiestudium an der Universität Bonn. Seit 2021 Promotion im Bereich Mikrobiologie unter Anleitung von Prof. Dr. U. Deppenmeier.
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Neff, A., Lück, R., Gindt, M. et al. Das unterschätzte biotechnologische Potenzial der Darmmikrobiota. Biospektrum 30, 52–54 (2024). https://doi.org/10.1007/s12268-024-2087-z
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