Abstract
CRISPR-mediated genome editing enables to study disease-relevant mutations. Next Generation Sequencing offers high throughput and accuracy but requires substantial investment. Nanopore sequencing on the other hand provides cheap entry. Here, we describe our work using sequencing techniques to identify edited cells, analyze mitochondrial DNA, and gene expression. Finally, we describe how our software tools CRISPRnano and Duesselpore aid to democratize the use of modern sequencing technologies.
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Literatur
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Jochen Dobner
2010–2016 Studium der Molekularen Zell- und Entwicklungsbiologie an der Universität Innsbruck, Österreich. 2021 Promotion an der Universität Düsseldorf. 2021–2022 PostDoc bei Prof. Dr. D. Willbold, Universität Düsseldorf. Seit 2022 PostDoc bei Dr. A. Rossis Lab, IUF–Leibniz-Institut für umweltmedizinische Forschung.
Andrea Rossi
1999–2005 Studium der Pharmazie, Universität Bari, Italien. 2009 Promotion in Biochemie und Molekularbiologie an der Universität Bari. 2010–2012 PostDoc in Alan Verkmans Labor an der University of California, San Francisco, USA. 2012–2018 PostDoc bei Prof. Dr. D. Stainiers, Max-Planck-Institut für Herz- und Lungenforschung, Bad Nauheim. Seit 2019 Arbeitsgruppenleiter des Genome Engineering and Model Development Labors, IUF–Leibniz-Institut für umweltmedizinische Forschung.
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Dobner, J., Rossi, A. Moderne Sequenzierungstechnologien und ihre Anwendungen. Biospektrum 29, 479–482 (2023). https://doi.org/10.1007/s12268-023-1989-5
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