International Journal of Legal Medicine

, Volume 107, Issue 1, pp 13–20

Variation in Short Tandem Repeat sequences —a survey of twelve microsatellite loci for use as forensic identification markers

Authors

  • A. Urquhart
    • The Forensic Science ServiceCentral Research and Support Establishment
  • C. P. Kimpton
    • The Forensic Science ServiceCentral Research and Support Establishment
  • T. J. Downes
    • The Forensic Science ServiceCentral Research and Support Establishment
  • P. Gill
    • The Forensic Science ServiceCentral Research and Support Establishment
Original Article

DOI: 10.1007/BF01247268

Cite this article as:
Urquhart, A., Kimpton, C.P., Downes, T.J. et al. Int J Leg Med (1994) 107: 13. doi:10.1007/BF01247268

Abstract

Alleles at 12 Short Tandem Repeat loci have been sequenced to investigate candidate loci for a multiplex Short Tandem Repeat system for forensic identification, and for single-locus amplification of Short Tandem Repeat loci. Variation from the consensus sequence was found at 6 loci, while one locus, D21S11, was found to be complex in sequence. The presence of non-consensus alleles does not rule out loci for inclusion as forensic identification markers, but size differences between alleles of 1 base pair require very precise sizing. We suggest criteria for the suitability of Short Tandem Repeat loci as forensic identification markers, and propose a universal allele nomenclature for simple and compound Short Tandem Repeats. The effect of the repeat unit sequence of the evolution of Short Tandem Repeats is discussed.

Key words

Short Tandem RepeatsMicrosatellites DNA sequencingPolymerase Chain ReactionForensic DNA typing

Zusammenfassung

Allele an 12 Short-Tandem-Repeat Loci wurden sequenziert, um Kandidaten für ein Multiplex Short Tandem Repeat System für forensische Identifikationen und für Single-Locus Amplifikationen von Short-Tandem-Repeat Loci zu untersuchen. Abweichungen von der Konsensus-Sequenz wurden an 6 Loci gefunden, während ein Locus, D21S11, als Komplex in der Sequenz gefunden wurde. Die Anwesenheit von Non-Konsensus-Allelen schließt solche Loci nicht aus für die Einbeziehung als forensische Identifikationsmarker. Aber Größendifferenzen von einem Basenpaar zwischen Allelen erfordern eine sehr genaue Größenbestimmung. Wir empfehlen Kriterien für die Eignung von Short-Tandem-Repeat Loci als forensische Identifikationsmarker und schlagen eine universale Allelnomenklatur für einfache und komplexe Short-Tandem-Repeats vor. Die Auswirkung der Sequenz der Repeateinheit auf die Entwicklung von Short-Tandem-Repeats wird diskutiert.

Schlüsselwörter

Short-Tandem-Repeats MikrosatellitenDNA-SequenzierungPolymerase KettenreaktionForensische DNA-Typisierung

Copyright information

© Springer-Verlag 1994